Najczęstszym problemem jaki się pojawia w okresie infekcyjnym jest kaszel i zapalenie oskrzeli.
Szczególnie dokładnie badamy układ oddechowy i wszelkie fenomeny osłuchowe.
Analizujemy potrzebę wdrożenia antybiotykoterapii na podstawie swojego doświadczenia klinicznego. Zawsze jest to problem diagnostyczny – czy leczenie antybiotykiem jest konieczne i mamy na uwadze liczne działania niepożądane antybiotyków. Jednakże trzeba brać pod uwagę ryzyko rozwoju infekcji bakteryjnej i to, że właściwości bakterii zmieniły się pod wpływem niewłaściwego stosowania tejże antybiotykoterapii. Bakterie obecnie stały się bardziej oporne, antybiotyk do nich nie dociera, gdyż często zasiedlają układ oddechowy w postaci biofilmu na nabłonku rzęskowym. Z drugiej zaś strony niewłaściwie leczona infekcja wirusowa doprowadza do powikłań bakteryjnych, powoduje przewlekanie się stanu zapalnego, co skutkuję nadwrażliwością drzewa oskrzelowego i może prowadzić do rozwoju astmy oskrzelowej.